不清洁提单是指货物交运时，其包装及表面状态出现不坚固完整等情况，船方可以批注，即为不清洁提单。承运人在装船时应对承运货物的外表状况负责，如发现货物已经受损或短缺，必须马上通知托运人修补或换货，或将这种损坏或短缺批注在提单上，否则在卸货港交付货物时，承运人根据提单记载效力的规定，应对损坏或短缺向收货人负赔偿责任。银行在办理结汇时，通常不接受不清洁提单。
不清洁提单的签发
实践中承运人接受货物时，假如货物外表状况不良，一般先在大副收据上作出记载，在正式签发提单时，再把这种记载转移到提单上。在国际贸易的实践中，银行是拒绝出口商以不清洁提单办理结汇的。为此，托运人应把损坏或外表状况有缺陷的货物进行修补或更换。习惯上的变通办法是由托运人出具保函，要求承运人不要将大副收据上所作的有关货物外表状况不良的批注转批到提单上，而根据保函签发清洁提单，以使出口商能顺利完成结汇。
不清洁提单的相关责任
假如承运人因未将大副收据上的批注转移提单上，承运人可能承担对收货人的赔偿责任，承运人因此遭受损失，应由托运人赔偿。那么，托运人是否能够赔偿，在向托运人追偿时，往往难以得到法律的保护，而承担很大的风险。承运人与收货人之间的权利义务是提单条款的规定，而不是保函的保证。所以，承运人不能凭保函拒赔，保函对收货人是无效的，假如承、托双方的做法损害了第三者收货人的利益，有违民事活动的老实信用的基本原则，轻易构成与托运人的串通，对收货人进行欺诈行为。
由于保函换取提单的做法，有时确实能起到变通的作用，故在实践中难以完全拒绝，我国最高人民法院在《关于保函是否具有法律效力问题的批复》中指出： “海上货物运输的托运人为换取清洁提单而向承运人出具的保函，对收货人不具有约束力。不论保函如何约定，都不影响收货人向承运人或托运人索赔；对托运人和承运人出于善意而由一方出具另一方接受的保函，双方均有履行之义务。”承运人应当清楚自己在接受保函后所处的地位，切不可掉以轻心。
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